人体微生物研究标准再扩围:细菌、病毒之外纳入「真菌」

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韩国疾病管理厅与保健福祉部修订指南,统一检体处理至遗传信息分析全流程标准

以医院为基础的人体微生物组研发项目运营指南在原有细菌与 病毒 研究领域基础上,新增真菌研究领域。 信息图=国立保健研究院

人体内并非只有细菌。皮肤、肠道、口腔、呼吸道等部位,还同时存在病毒以及霉菌、酵母等真菌。

此前主要面向细菌和病毒的国家微生物组研究标准,如今将扩展至真菌。相关部门希望借此减少因各研究机构在检体处理或遗传信息分析方法不同而造成的结果差异。

韩国疾病管理厅国立保健研究院20日表示,已与保健福祉部共同发布《以医院为基础的人体微生物组研发项目运营指南》修订版。

微生物组(Microbiome)是指生活在人或动植物、土壤、海洋等特定环境中的微生物及其所携带遗传信息的总称。相关研究可用于理解疾病发生与进展过程,或寻找新的诊断与治疗方法。

此次修订的核心变化之一,是在细菌和病毒之外,将真菌微生物组「真菌组(Mycobiome)」也纳入标准化研究对象。

数量少且DNA提取更棘手……真菌研究为何更难

真菌可在肠道、皮肤、口腔、呼吸道等多个人体部位被发现。近年来,围绕真菌如何与免疫系统或其他微生物相互作用,以及其与多种疾病可能存在何种关联的研究也在增加。

但与细菌相比,真菌研究难度更高。在人体样本中,真菌数量往往少于细菌;同时由于其细胞壁坚硬,DNA要实现充分提取并不容易。

检体如何采集与保存、采用何种方法提取DNA,都可能导致结果不同。选择分析的基因区域也会产生影响。

污染控制同样关键。因为在真菌含量较低的样本中,来自环境或实验室试剂混入的真菌DNA,可能会像真实存在于人体内一样被检出。

这也解释了为何即便分析同一样本,不同研究机构仍可能得出不同结果。

《以医院为基础的人体微生物组研发项目运营指南》修订版封面
照片=国立保健研究院

从检体处理到遗传信息分析的统一标准

韩国疾病管理厅表示,为减少上述差异,修订版新增了真菌研究的通用流程与标准,并提出可在各研究阶段适用的规范,覆盖从检体处理到遗传信息分析的全过程。

其目标是减少不同研究机构之间分析结果不一致的问题,使不同机构产出的数据能够相互比较或联合使用。

既有指南也根据变化的研究环境与分析技术作出调整。在涵盖细菌的「细菌组(Bacteriome)」、涵盖病毒的「病毒组(Virome)」基础上,进一步加入真菌组,从而拓展人体微生物研究的范围。

同时,指南还制定了将患者临床信息与微生物遗传信息进行联合分析的标准。通过把疾病或治疗信息与微生物组数据一并审视,以确认特定微生物的变化与疾病之间存在何种关联。

不过,仅凭某种微生物在患者体内偏多或偏少这一事实,无法断定其就是疾病原因。微生物组会受到饮食结构、药物、生活环境、免疫状态等多种因素影响。要阐明与疾病之间的因果关系,仍需进一步研究。

《以医院为基础的人体微生物组研发项目》框架 照片=国立保健研究院

至2027年投入499亿韩元……夯实面向韩国人的定制诊断与治疗研究基础

本次指南是韩国疾病管理厅与保健福祉部自2023年起推进的《以医院为基础的人体微生物组研发项目》的一部分。

第一阶段项目将持续5年,至2027年结束,总经费为499亿韩元。其中,韩国疾病管理厅投入245亿韩元,保健福祉部投入254亿韩元。

项目目标是建立可对医院获取的临床信息与微生物组数据进行联合分析的基础,并将其进一步用于开发适合韩国人的诊断方法与治疗药物。

指南将向项目参与机构之外的高校、医院与研究机构公开使用。国立保健研究院计划向相关学会与研究机构介绍指南内容,并结合一线意见与技术变化持续完善。

国立保健研究院传染病研究中心主任蔡熙烈表示:“微生物组研究正从细菌迅速扩展到病毒、真菌等领域。为提升研究结果的可信度与可用性,标准化至关重要。”他还说:“期待该指南能作为通用标准,使各机构生成的数据能够被可靠地比较与联动。”

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