La investigación del microbioma humano estandariza también el estudio de los hongos, más allá de bacterias y virus

En nuestro cuerpo no viven solo bacterias. En la piel, el intestino, la boca y las vías respiratorias, entre otros, también hay virus y hongos —incluidas levaduras—.

El estándar nacional de investigación del microbioma, hasta ahora centrado en bacterias y virus, se amplía para incluir también los hongos. El objetivo es reducir las discrepancias en los resultados que se producen cuando cada institución procesa las muestras o analiza la información genética con métodos distintos.

El Instituto Nacional de Investigación Sanitaria de la Agencia para el Control y la Prevención de Enfermedades de Corea (KDCA) informó el día 20 de que, junto con el Ministerio de Salud y Bienestar, ha publicado la edición revisada de la «Guía operativa del programa de I+D sobre el microbioma humano basado en hospitales».

El microbioma se refiere al conjunto de microorganismos que habitan un entorno específico —como el ser humano, animales y plantas, el suelo o el mar— y a la información genética que poseen. Se utiliza en investigaciones para comprender cómo aparecen y progresan las enfermedades o para encontrar nuevos métodos de diagnóstico y tratamiento.

El cambio más destacado de esta revisión es que, tras bacterias y virus, incorpora también como objeto estándar de investigación el microbioma fúngico, el «micobioma (Mycobiome)».

Menor abundancia y extracción de ADN más compleja: por qué es difícil investigar los hongos

Los hongos se detectan en diversas partes del cuerpo humano, como el intestino, la piel, la cavidad oral y las vías respiratorias. En los últimos años también han aumentado los estudios que buscan aclarar cómo interactúan los hongos con el sistema inmunitario u otros microorganismos, y qué relación guardan con distintas enfermedades.

Sin embargo, investigarlos resulta más complejo que en el caso de las bacterias. En muchas muestras humanas, los hongos suelen estar en menor cantidad que las bacterias, y su pared celular rígida dificulta extraer suficiente ADN.

Los resultados también pueden variar según cómo se haya recogido y conservado la muestra, o según el método utilizado para extraer el ADN. También influye qué región genética se elija para el análisis.

El control de la contaminación es igualmente clave. En muestras con pocos hongos, el ADN fúngico procedente del entorno o de reactivos de laboratorio puede mezclarse y detectarse como si perteneciera realmente al cuerpo humano.

Por eso, incluso al analizar la misma muestra, los resultados pueden diferir entre instituciones de investigación.

Criterios comunes desde el tratamiento de muestras hasta el análisis genético

Para reducir estas diferencias, la KDCA ha incorporado en esta edición revisada procedimientos y criterios comunes específicos para la investigación de hongos. Presenta estándares aplicables por etapas del estudio, desde el tratamiento de las muestras hasta el análisis de la información genética.

El objetivo es disminuir el problema de que los resultados varíen entre instituciones y permitir comparar o utilizar conjuntamente datos generados por organismos distintos.

Las directrices existentes también se han ajustado al nuevo entorno de investigación y a las técnicas de análisis. Al sumar el micobioma al «bacterioma (Bacteriome)», centrado en bacterias, y al «viroma (Virome)», centrado en virus, se amplía el alcance de la investigación sobre microorganismos humanos.

También se han establecido criterios para analizar conjuntamente la información clínica del paciente y la información genética de los microorganismos. El propósito es revisar de forma integrada los datos de enfermedades o tratamientos con los del microbioma para comprobar qué relación guarda el cambio de determinados microorganismos con una patología.

No obstante, el hecho de que un microorganismo concreto sea más o menos abundante en un paciente no permite concluir por sí solo que sea la causa de una enfermedad. El microbioma está influido por múltiples factores, como la dieta, los fármacos, el entorno de vida y el estado inmunitario. Para esclarecer la relación causal con las enfermedades se necesitan investigaciones adicionales.

Hasta 2027, inversión de 49.900 millones de wones: base para diagnósticos y tratamientos adaptados a la población coreana

Estas directrices forman parte del «programa de I+D sobre el microbioma humano basado en hospitales» que la KDCA y el Ministerio de Salud y Bienestar impulsan desde 2023.

La primera fase del programa se desarrollará durante cinco años, hasta 2027, con un presupuesto total de 49.900 millones de wones. La KDCA aportará 24.500 millones de wones y el Ministerio de Salud y Bienestar, 25.400 millones de wones.

El objetivo es establecer una base que permita analizar conjuntamente la información clínica obtenida en hospitales y los datos del microbioma, y vincularlo al desarrollo de métodos diagnósticos y terapias adaptados a la población coreana.

La guía se hará pública para que pueda utilizarse no solo en las instituciones participantes del programa, sino también en universidades, hospitales y centros de investigación. El Instituto Nacional de Investigación Sanitaria difundirá el contenido entre sociedades científicas y organismos de investigación relacionados, y prevé seguir perfeccionándolo incorporando opiniones del terreno y cambios tecnológicos.

Chae Hee-yeol, director del Centro de Investigación de Enfermedades Infecciosas del Instituto Nacional de Investigación Sanitaria, afirmó: «La investigación del microbioma se está expandiendo rápidamente desde las bacterias hacia los virus y los hongos, por lo que la estandarización es importante para aumentar la fiabilidad y la utilidad de los resultados». Y añadió: «Esperamos que sirva como un criterio común que permita comparar y vincular de forma fiable los datos producidos por cada institución».