私たちの体内にいるのは細菌だけではありません。皮膚や腸、口腔、呼吸器などには、ウイルスやカビ・酵母などの真菌も共存しています。
これまで細菌とウイルスに重点を置いてきた国家マイクロバイオーム研究の標準が、真菌にも広がります。研究機関ごとに検体の取り扱いや遺伝情報の解析方法が異なり、結果に差が出る課題を減らす狙いです。
疾病管理庁と国立保健研究院は保健福祉部と共同で、「病院基盤ヒト・マイクロバイオーム研究開発事業 運営ガイドライン」改定版を発刊したと20日、発表しました。
マイクロバイオームは、人や動植物、土壌、海など特定の環境に生息する微生物と、それらが持つ遺伝情報を合わせた概念です。疾病の発生・進行過程の理解や、新たな診断・治療法を探る研究に活用されます。
今回の改定で最も大きいのは、細菌とウイルスに続き、真菌マイクロバイオームである「マイコバイオーム（Mycobiome）」を標準の研究対象に加えた点です。
量が少なくDNA抽出も難しい…真菌研究はなぜ難しいのか
真菌は腸や皮膚、口腔、呼吸器など、さまざまな人体部位で見つかります。近年は、真菌が免疫系や他の微生物とどのように相互作用するのか、複数の疾患とどのような関連があるのかを明らかにしようとする研究も増えています。
ただ、細菌に比べると研究は難しいとされています。人体検体では真菌の量が細菌より少ない場合が多く、硬い細胞壁のためDNAを十分に抽出する工程も容易ではありません。
検体をどのように採取・保管したか、どの方法でDNAを抽出したかによっても結果が変わり得ます。解析対象とする遺伝子領域をどこに設定したかも影響します。
汚染管理も重要です。真菌が少ない検体では、環境や実験室の試薬から混入した真菌DNAが、実際に人体に存在していたかのように検出される可能性があるためです。
同じ検体を解析しても、研究機関によって結果が異なり得る理由です。
写真＝国立保健研究院
検体処理から遺伝情報解析まで共通基準
疾病管理庁は、こうした差を減らすため、改定版に真菌研究の共通手順と基準を新たに盛り込みました。検体処理から遺伝情報解析まで、研究段階ごとに適用できる基準を示しました。
研究機関ごとに解析結果が異なる問題を抑え、異なる機関から得られたデータを比較したり共同利用したりできるようにするのが狙いです。
既存の指針も、変化した研究環境と解析技術に合わせて見直しました。細菌を扱う「バクテリオーム（Bacteriome）」、ウイルスを扱う「バイローム（Virome）」にマイコバイオームを加え、人体微生物研究の範囲を広げました。
患者の臨床情報と微生物の遺伝情報を併せて解析できるよう、基準も整備しました。疾患や治療情報とマイクロバイオームデータを一緒に見て、特定の微生物の変化が疾患とどのように関連するかを確認するためです。
ただし、特定の微生物が患者に多い、あるいは少ないという事実だけで、疾病の原因だと断定することはできません。マイクロバイオームは食生活や薬剤、生活環境、免疫状態など多様な要因の影響を受けます。疾病との因果関係を明らかにするには追加研究が必要です。
2027年までに499億ウォン投入…韓国人向け診断・治療研究の基盤構築
今回のガイドラインは、疾病管理庁と保健福祉部が2023年から推進している「病院基盤ヒト・マイクロバイオーム研究開発事業」の一環です。
第1段階事業は2027年までの5年間実施し、総事業費は499億ウォンです。疾病管理庁が245億ウォン、保健福祉部が254億ウォンを投入します。
病院で確保した臨床情報とマイクロバイオームデータを併せて解析できる基盤を整え、これを韓国人に適した診断法と治療薬の開発につなげることが目標です。
ガイドラインは事業参加機関に限らず、大学・病院・研究機関でも使えるよう公開します。国立保健研究院は関連学会や研究機関に内容を周知し、現場の意見や技術の変化を反映して継続的に補完する計画です。
チェ・ヒヨル国立保健研究院 感染症研究センター長は「マイクロバイオーム研究が細菌からウイルスや真菌などへ急速に拡大しており、研究結果の信頼性と活用性を高めるための標準化が重要です」と述べ、「機関別に生産したデータを信頼性高く比較・連携できる共通基準として活用されることを期待します」と語りました。
