On parle de « bactériémie » lorsque des bactéries ou des champignons responsables d’une pneumonie, d’une infection urinaire, etc., passent dans le sang. Comme l’agent infectieux peut ensuite se disséminer dans tout l’organisme via la circulation sanguine, il est crucial d’identifier rapidement le germe en cause et d’administrer un antibiotique adapté.
Mais constater une croissance microbienne lors d’une hémoculture ne signifie pas que le traitement optimal est immédiatement connu. Il faut encore du temps pour identifier précisément l’agent causal et vérifier à quels antibiotiques il est sensible.
L’équipe du professeur Kim Keun-joo, du service de médecine de laboratoire de l’hôpital Anam de la Korea University, a indiqué le 3 que l’ajout d’un test rapide de réaction en chaîne par polymérase (PCR) multiplex chez des patients dont l’hémoculture est positive réduisait de 41,3 heures le délai avant le premier ajustement du traitement vers un antibiotique efficace. Dans un essai randomisé contrôlé, les chercheurs ont montré que ce test pouvait nettement réduire le temps nécessaire aux soignants pour adapter la prise en charge des bactériémies.
Détecter en une seule fois plusieurs agents et des gènes de résistance
La bactériémie est une infection grave qui peut survenir lorsque des bactéries ou des champignons se propagent dans le sang à partir d’une pneumonie, d’une infection urinaire, d’une infection intra-abdominale, d’une infection liée à un cathéter veineux, etc. Identifier rapidement l’agent causal et choisir un antibiotique approprié constitue un enjeu central du traitement.
La « PCR multiplex » utilisée dans cette étude permet, en un seul test, de détecter simultanément plusieurs types de bactéries et de champignons, ainsi que certains gènes de résistance aux antibiotiques.
Elle ne remplace toutefois pas l’hémoculture classique. Elle consiste à réanalyser par PCR rapide un échantillon dont l’hémoculture est positive afin d’identifier plus vite l’agent causal et certaines informations de résistance, et de fournir plus tôt aux soignants des éléments pour orienter la stratégie thérapeutique.
Pour confirmer précisément l’agent causal et déterminer définitivement la sensibilité aux antibiotiques, la culture classique reste nécessaire. La PCR rapide sert à détecter rapidement plusieurs agents et certains gènes de résistance ; elle ne fournit pas d’emblée la sensibilité à l’ensemble des antibiotiques.
L’équipe a évalué si l’ajout de ce test permettait, dans la pratique, d’accélérer les décisions thérapeutiques chez les patients.
418 patients répartis au hasard, comparaison du parcours de soins en conditions réelles
L’étude a porté sur 418 adultes hospitalisés à l’hôpital Anam de la Korea University, chez qui une hémoculture positive a été confirmée entre juin et octobre 2025.
Au total, 208 patients ont bénéficié uniquement des examens standards, tandis que 210 ont eu, en plus, une PCR multiplex rapide. Il s’agit d’un « essai prospectif randomisé contrôlé » : les patients ont été répartis aléatoirement en deux groupes dès le début de l’étude, puis les résultats thérapeutiques ont été comparés. Autrement dit, il ne s’agissait pas d’une comparaison rétrospective à partir de dossiers médicaux, mais d’une observation prospective visant à mesurer, en conditions réelles, les différences induites par les deux stratégies diagnostiques.
Les deux groupes ont également bénéficié d’un programme de « bon usage des antibiotiques » visant à optimiser le choix des traitements et à réduire les prescriptions inutiles.
Passer à un antibiotique efficace : de 64,5 heures à 23,2 heures
Le moment où la prescription était effectivement modifiée a, lui aussi, été nettement avancé.
Le délai médian avant le premier changement de prescription vers un antibiotique efficace est passé de 64,5 heures dans le groupe examens standards à 23,2 heures dans le groupe PCR rapide, soit un gain de 41,3 heures.
L’effet ne s’est pas limité à un agent causal particulier. Pour les infections à bacilles Gram négatif, à cocci Gram positif et les infections fongiques, le délai d’ajustement du traitement a également diminué de manière significative.
Chez les patients en réanimation, l’écart était encore plus marqué.
Le délai médian avant le premier changement de prescription vers un antibiotique efficace est passé de 84,8 heures dans le groupe examens standards à 20,5 heures dans le groupe PCR rapide, soit 64,3 heures de moins — environ deux jours et 16 heures gagnés.
Dans les services d’hospitalisation conventionnelle, il a été réduit de 55,5 heures à 23,4 heures. Le délai d’ajustement du traitement a diminué de façon significative non seulement pendant les horaires habituels de fonctionnement du laboratoire, mais aussi la nuit ou les jours fériés, c’est-à-dire en dehors des plages standard.
C’est pourquoi l’intérêt du test rapide ne se résume pas à « recevoir un résultat quelques heures plus tôt ». Le moment où l’on bascule effectivement vers un antibiotique efficace chez le patient a, lui aussi, été avancé.
Deux fois moins de patients avec persistance du même germe dans le sang
L’impact d’une décision thérapeutique plus rapide s’est également reflété dans la proportion d’infections persistantes.
La « bactériémie persistante », définie par la détection continue du même agent causal dans le sang après un certain délai, est survenue chez 11,5 % des patients du groupe examens standards, contre 5,7 % dans le groupe PCR rapide. La proportion a ainsi été réduite de moitié.
En revanche, tous les indicateurs ne se sont pas améliorés. Aucune différence statistiquement significative n’a été observée entre les deux groupes pour la mortalité à 30 jours et la durée totale d’hospitalisation.
Cette seule étude ne permet donc pas de conclure que la PCR rapide réduit le risque de décès ou la durée de séjour.
Plus que la vitesse du test, « utiliser rapidement le bon antibiotique » est plus important
Le principal enseignement de l’étude ne tient pas seulement à l’accélération du test, mais au fait que ses résultats ont permis d’avancer les décisions thérapeutiques.
Au début d’une bactériémie, des antibiotiques peuvent être administrés de manière empirique avant l’identification précise de l’agent causal et les résultats de sensibilité. Disposer rapidement d’informations sur l’agent et la résistance permet de passer plus tôt à un médicament efficace ou d’ajuster le spectre du traitement.
Le professeur Kim Keun-joo a déclaré : « Nous avons confirmé, par un essai randomisé contrôlé, que le diagnostic moléculaire rapide ne se limite pas à fournir plus vite des résultats, mais peut avancer de manière importante les décisions de traitement antibiotique efficace chez les patients » ; il a ajouté : « Si l’on relie étroitement un diagnostic rapide à un dispositif de bon usage des antibiotiques, cela aidera à offrir aux patients atteints de bactériémie un traitement plus rapide et plus précis. »
Dans cette étude, le professeur Kim Keun-joo et le professeur Yoon Young-kyung, du service des maladies infectieuses, ont participé en tant que co-premiers auteurs. Le professeur Nam Myung-hyun, du service de médecine de laboratoire, et le professeur Son Jang-wook, du service des maladies infectieuses, ont supervisé l’étude en tant que co-auteurs correspondants.
Les résultats ont été publiés en ligne le 20 août dans 《Clinical Infectious Diseases》, revue officielle de l’Infectious Diseases Society of America (IDSA). Ils ont également été sélectionnés pour la rubrique « Editor’s Choice », dans laquelle la rédaction met en avant des travaux majeurs.
