Perles magnétiques coréennes : « Déterrer les secrets des cellules cancéreuses »

Il existe différents « visages » même à l'intérieur des cellules cancéreuses. Bien qu'elles semblent former une masse tumorale identique, chaque cellule présente un profil d'expression génique différent. C'est pourquoi certains médicaments anticancéreux fonctionnent sur certaines cellules mais pas sur d'autres. C'est aussi la raison pour laquelle la médecine génomique accorde de plus en plus d'attention à l'analyse des cellules uniques.

Cependant, pour que cette analyse soit correcte, l'étape de préparation de l'échantillon avant d'être mise dans l'appareil d'analyse (le processus de prétraitement pour préparer l'échantillon proprement) est décisive. Tout comme il est difficile d'observer et d'analyser avec précision si la lame est contaminée, même avec un microscope performant. Deux entreprises biopharmaceutiques coréennes se sont associées pour combler cette lacune entre le 'prétraitement' et l' 'analyse'.

Quand le « nettoyeur » rencontre le « détective »

Gravis Co., Ltd. (représenté par Lee Jin-yeop) et DecodeCell Co., Ltd. (représenté par Kim Se-won) ont signé un MOU le 6, dans la salle de réunion de Gravis à Guro-gu, Séoul, pour renforcer la compétitivité dans le domaine de l'analyse génomique de nouvelle génération et de l'omics multiple à cellule unique. Un modèle de coopération qui aiguise les 'avant' et 'arrière' du pipeline NGS (séquençage de nouvelle génération).

Gravis se concentre sur la technologie des 'perles magnétiques' utilisées dans le processus de préparation de la bibliothèque NGS. Les perles magnétiques sont des particules ultrafines qui attirent certaines substances comme le ferait un aimant, jouant le rôle de sélectionner et de purifier l'ADN ou l'ARN et de filtrer les fragments inutiles. En d'autres termes, c'est un 'nettoyeur' qui élimine le bruit des matériaux génétiques. Ce matériau a jusqu'à présent été largement importé. Gravis l'a localisé. C'est également une société d'investissement de l'Université de Corée et de l'Université de Busan.

DecodeCell apparaît de l'autre côté. Elle se spécialise dans l'analyse des transcriptomes de cellules uniques, des transcrits spatiaux, de l'analyse génomique, et des services d'omics multiples qui les examinent tous en même temps. Elle joue le rôle de 'détective' qui lit avec précision quels gènes chaque cellule « active » et quel signal elle émet à quel endroit dans le tissu. Elle a fourni des solutions d'analyse personnalisées aux institutions de recherche et aux entreprises biopharmaceutiques, tant nationales qu'internationales.

Un 'workflow' local avec des avantages en termes de coût, de qualité et de vitesse

La valeur clé de ce MOU réside dans la connexion des deux technologies pour créer un environnement où les chercheurs coréens peuvent effectuer une analyse génomique de bout en bout sur une plateforme coréenne. Actuellement, le domaine de la recherche génomique en Corée dépend largement de produits étrangers, depuis les matériaux de prétraitement jusqu'aux logiciels d'analyse. Cela entraîne des coûts élevés, une vulnérabilité aux problèmes de chaîne d'approvisionnement, et des possibilités de personnalisation limitées.

Si les perles magnétiques de Gravis augmentent la qualité et le rendement de la purification de l'ADN et de l'ARN au stade de prétraitement, la plateforme d'analyse des cellules uniques de DecodeCell peut produire des résultats d'omics plus précis avec des données d'entrée plus propres. La qualité du processus en amont détermine directement la précision du processus en aval.

Kim Se-won, le représentant de DecodeCell, a déclaré : "Cet accord n'est pas simplement une collaboration de produits, mais un point de départ pour une coopération de plateforme qui améliore à la fois l'accessibilité sur le terrain de recherche et l'applicabilité industrielle en combinant les matériaux clés de prétraitement et les capacités d'analyse d'omics multiples à cellule unique." Cela permet aux chercheurs nationaux d'accéder à des technologies d'omics avancées à un coût inférieur.

Au-delà des laboratoires vers la clinique... vers la médecine de précision et le développement de nouveaux médicaments

Cependant, cela ne se limite pas à une simple coopération de réactifs et de services pour la recherche. Cela va au-delà. La découverte de biomarqueurs, la médecine de précision, le diagnostic, la recherche clinique, et le développement de nouveaux médicaments sont des mots-clés qui avancent d'un pas supplémentaire vers l'objectif de ce MOU.

L'analyse des cellules uniques est déjà devenue un outil clé dans le développement de nouveaux médicaments à l'échelle mondiale. Par exemple, la découverte de biomarqueurs pour prédire la réponse aux immunothérapies anticancéreuses ou l'analyse des transcrits spatiaux qui cartographie l'environnement tumoral (TME) d'une tumeur spécifique sont utilisées pour identifier les cibles des nouveaux médicaments et affiner les groupes de patients cliniques. La technologie des transcrits spatiaux dessine une « carte tissulaire » qui montre quelles cellules activent quels gènes à quel endroit, ce qui est particulièrement utile pour comprendre la distribution des cellules immunitaires autour de la tumeur ou les schémas d'invasion des cellules cancéreuses.

Si le matériau de prétraitement de Gravis assure de manière stable la qualité des échantillons pour ces analyses complexes, le service d'omics multiples de DecodeCell devient un 'moteur d'analyse' qui fournit les insights cliniques nécessaires aux équipes de recherche des entreprises pharmaceutiques et des hôpitaux.

Lee Jin-yeop, le représentant de Gravis, a déclaré : "La technologie des perles magnétiques de Gravis est un matériau clé qui influence directement la précision et l'efficacité du prétraitement NGS" et a ajouté : "Grâce à cette coopération, nous allons vérifier de manière plus systématique l'impact de la qualité du prétraitement sur les résultats d'analyse des cellules uniques et d'omics multiples, et élargir la possibilité d'application dans la découverte de biomarqueurs et dans les domaines du diagnostic et clinique, afin de compléter une plateforme d'analyse locale de niveau mondial."

Autonomie technologique et compétitivité mondiale... vers une plateforme d'analyse de médecine de précision 'K-Health'

Cette coopération a également pour signification d'améliorer l'autonomie des matériaux et des composants dans l'écosystème de recherche biopharmaceutique coréen. La localisation des perles magnétiques de Gravis peut être lue dans le même contexte que la localisation des matériaux semi-conducteurs. Cela réduit la vulnérabilité structurelle qui fait que la recherche peut s'arrêter chaque fois que la chaîne d'approvisionnement est perturbée.

À court terme, cela contribue à réduire les coûts et à élargir l'accessibilité sur le terrain de recherche, et à moyen et long terme, c'est une stratégie pour valider un modèle de plateforme d'analyse génomique basé sur des produits coréens sur le marché mondial. Cela vise à renforcer la compétitivité en termes de prix et de fiabilité des solutions intégrées coréennes sur le marché biopharmaceutique d'Asie et d'Asie du Sud-Est, ainsi que sur les marchés émergents où les réglementations sur la médecine de précision sont assouplies.

Actuellement, le marché de l'analyse génomique est à une époque où les 'appareils' sont déjà commercialisés. Aujourd'hui, le centre de gravité de la concurrence se déplace vers les consommables et matériaux autour des appareils, et vers la précision de l'interprétation des données.

La coopération entre Gravis et DecodeCell attire particulièrement l'attention en tant qu'essai de relier ces deux axes, à savoir des matériaux de prétraitement de haute qualité et des services d'analyse précis, sous une marque locale. Les deux entreprises ont déclaré : "Nous prévoyons de contribuer à l'autonomie technologique et au renforcement de la compétitivité industrielle de l'écosystème de recherche biopharmaceutique coréen, tout en concrétisant progressivement un modèle de plateforme d'analyse locale compétitif sur le marché mondial."